2022/09/19 周一 21:33:45.09

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 ### 2.2.2 Feature extraction of drugs
 在代表蛋白质之后，药物分子也需要被矢量化。类似地，我们还从药物分子中提取了局部视图和全局视图的特征。与蛋白质序列不同，药物分子是以原子为节点、以化学键为边的图形。这意味着类k-mer信息的统计不再适用。因此，我们选择了另一种全局视图的表示技术：分子指纹。分子指纹将药物分子编码成一系列二进制数字，其中隐含着一些子结构和拓扑信息(Rogers和Hahn，2010)。至于局部视图的表示，类似于蛋白质，我们也使用了一些CNN。首先，我们将药物的每个原子编码成一个75维的向量，其中包含原子和键的物理化学特征(Ramsundar等人，2019年)。然后，利用极大合并的细胞神经网络从75维向量中提取特征，并将提取的特征送入3层模糊神经网络，得到药物分子的最终局部特征。具体地说，对于具有ld原子的药物j，其最终表示dj 2 rdh定义为：
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 ### 2.2.3 Bridge graph’s construction